Cuốn sách Sinh Học Cơ Bản Và Nâng Cao 9 được trình bày theo từng chương, trong mỗi chương có các bài cụ thể theo chương trình sách giáo khoa. Ở mỗi bài, cuốn sách được trình bày theo 2 phần: Kiến thức cơ bản & nâng cao và câu hỏi & bài tập.

Những nội dung này nhằm giúp các em sau khi học bài ở trên lớp có thể ôn tập lại một cách ngắn gọn, đầy đủ, chính xác các kiến thức của mỗi bài, rồi tiến hành kiểm tra lại kiến thức của bản thân bằng các thao tác tư duy để giải quyết những tình huống mới. Câu hỏi và bài tập được trình bày từ dễ đến khó, có nhiều câu hỏi và bài tập đòi hỏi tư duy, sáng tạo của các em.